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                薄層層析法測定氯霉素酰基轉(zhuǎn)移酶含量實(shí)驗(yàn)

                發(fā)布時(shí)間: 2021-12-16  點(diǎn)擊次數(shù): 962次

                材料與儀器

                用攜帶感興趣 DNA 的 pCAT 載體轉(zhuǎn)染的哺乳動(dòng)物培養(yǎng)細(xì)胞
                CAT 反應(yīng)混合物 1 乙基乙酸 裂解緩沖液 不含鈣鹽和鎂鹽的磷酸鹽緩沖液 薄層層析(TLC) 溶劑 Tris-Cl 放射性墨水
                干冰 乙醇浴 不溶于乙醇的墨水的記號筆 旋轉(zhuǎn)真空蒸發(fā)器 橡膠棒 薄層層析板 薄層層析槽 預(yù)設(shè)為 65°C 的水浴

                步驟

                材料

                緩沖液和溶液
                貯存液、緩沖液和試劑的組分請見附錄 1。
                貯存液稀釋到適當(dāng)濃度。

                CAT 反應(yīng)混合物 1
                1mol/LTris-Cl(pH7.8)50ul
                [14C] 氯霉素 (60mCi/mmol, 用水稀釋到 0.1mCi/ml)10ul
                乙酰輔酶 A(新鮮配制,水溶液濃度 3.5 mg/ml)20ul
                每測定 50ul 細(xì)胞裂解物需要準(zhǔn)備 80ulCAT 反應(yīng)混合物。反應(yīng)混合物在臨用前配制。
                乙酰酶 A 是輔酶 A 的 S-乙酰基化形式。兩個(gè)碘單位以這種形式從脂肪和碳水化合物進(jìn)入檸檬酸循環(huán)。乙酰輔酶 A 在很多生物反應(yīng)中作為乙酰基化的輔助因子,如在本方案中,通過 CAT 使氯霉素酰基化就需要乙酰輔酶 A 作為輔助因子。

                乙基乙酸
                乙基乙酸(CH2COOCH2CH3) 是用于 CAT 活性薄層層析測定的有機(jī)溶劑。1 份乙基乙酸和 19 份氯仿混合制成的溶劑可以把乙酰基化和非乙酰基化形式的氯霉素在硅膠板上分開。乙基乙酸是非常易燃(閃燃點(diǎn)=-4°C) 的揮發(fā)性酯類,有成熟水果的味道。



                裂解緩沖液
                0.1mol/LTris-Cl(pH7.8)
                0.5%(V/V)TritonX-100
                通過去污劑裂解細(xì)胞時(shí)使用(請見步驟 4)。
                同樣的裂解緩沖液可制備用于測量β-半乳糖苷酶活性的細(xì)胞抽提物(請見方案 7)。
                重要:細(xì)胞裂解緩沖液需用髙純度的 TritonX-100 制品。低等級的去污劑會抑制 CAT 酶活性。裂解緩沖液中可以用去污劑0.125%(V/V) 的 NonidetP-40 代替 TritonX-100。

                不含鈣鹽和鎂鹽的磷酸鹽緩沖液(PBS)

                薄層層析(TLC) 溶劑
                190 ml 氯仿
                10 ml 甲醇
                毎個(gè) TLC 槽需要準(zhǔn)備 200 ml。每個(gè)槽可以用兩個(gè) TLC 板。

                Tris-Cl(1mol/L,pH7.8)

                放射性化合物

                放射性墨水
                用于作點(diǎn)標(biāo)記,指示 TCL 柜放射自顯影圖的方向。

                特殊設(shè)備

                干冰/乙醇浴
                用于凍融法裂解細(xì)胞。

                使用不溶于乙醇的墨水的記號筆

                旋轉(zhuǎn)真空蒸發(fā)器
                例如 Savant Speed Vac 牌。

                橡膠棒

                薄層層析板(例如 Sybron SIL G/UV254,Brinkmann 公司)

                薄層層析槽(27.5 cm X27.5 cm X7.5 cm)
                科學(xué)供應(yīng)品商店提供這類槽(如 Sigma-Aldrich Techware 公司)。

                預(yù)設(shè)為 65°C 的水浴

                細(xì)胞和組織

                用攜帶感興趣 DNA 的 pCAT 載體轉(zhuǎn)染的哺乳動(dòng)物培養(yǎng)細(xì)胞
                需要用一個(gè) CAT 報(bào)道分子載體(如 pCAT3 系列)和帶有β-半乳糖苷酶基因(pCMV-SPORT-β-gal;請見第 16 章圖 16-2) 或其他適于使 CAT 測量結(jié)果標(biāo)準(zhǔn)化的報(bào)進(jìn)基因的質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染(使用第 16 章中的某種轉(zhuǎn)染方案)細(xì)胞。pCAT 系列載體的詳細(xì)情況請見圖 17-3。

                方法

                轉(zhuǎn)染細(xì)胞沉淀的制備

                1. 從經(jīng)過轉(zhuǎn)染并在 90 mm 組織培養(yǎng)皿中生長的單層細(xì)胞輕輕地吸掉培養(yǎng)液。單層細(xì)胞用 5 ml 不含鈣鹽和鎂鹽的 PBS 洗 3 次。

                2. 把培養(yǎng)皿以某個(gè)角度放置 2~3 min,使最后殘留的 PBS 流到一側(cè)。吸掉 PBS 殘液。每個(gè)培養(yǎng)皿加 lmlPBS,用橡膠棒把細(xì)胞刮到離心管中。冰浴,直到所有的培養(yǎng)皿處理完畢。

                3. 室溫下以最大速度離心 10s 收集細(xì)胞。用 lml 冰冷的 PBS 輕輕地重懸細(xì)胞沉淀,然后再次離心收集細(xì)胞。去掉細(xì)胞沉淀與管壁中的 PBS 殘液。細(xì)胞沉淀可以貯存在-20°C 以作將來分析用,也可以用步驟 4 的某種方法制備細(xì)胞抽提物。
                用連有真空管的一次性吸頭可以很方便地去除 PBS。吸頭接觸液面,緩緩地吸。當(dāng)液體下降的時(shí)候. 使吸頭盡可能地遠(yuǎn)離細(xì)胞沉淀,然后用吸頭吸掉沾附在管壁上的液滴。

                制備細(xì)胞抽提物

                4. 裂解細(xì)胞是用反復(fù)凍融法或用含有去污劑的緩沖液處理細(xì)胞。后一種方法快速簡便,而且適用于在 96 孔板上測量 CAT、β-半乳糖苷酶和其他標(biāo)記基因(方案 6)(Bignon et al.1993)。

                反復(fù)凍融法裂解細(xì)胞

                a. 在 90 mm 培養(yǎng)皿中,用 l00ul 0.25mol/L Tris-Cl(pH7.8) 重懸細(xì)胞沉淀。劇烈振蕩打散細(xì)胞團(tuán)塊。

                b. 細(xì)胞在干冰/乙醇浴中凍,在 37°C 融解,并進(jìn)行 3 個(gè)循環(huán)以破壞細(xì)胞。確定管子事先用不溶于乙醇的墨水進(jìn)行過標(biāo)記。

                c. 破碎的細(xì)胞在 4°C 以最大速度離心 5 min。上清轉(zhuǎn)移到新的離心管中。取 50ul 上清用于測量 CAT, 余下的抽提物貯存于-20°C。

                用含有去污劑的緩沖液裂解細(xì)胞

                a. 步驟 3 中的細(xì)胞沉淀用 500ul 裂解緩沖液重懸。混合物在 37°C 孵育 15 min。
                在 35 mm 培養(yǎng)血中生長的細(xì)胞抽提時(shí)需要用 100ul 裂解緩沖液。

                b. 以最大速度離心 10 min 去除細(xì)胞碎片。回收上淸。選用一種本方案所述的方法來測量 CAT 活性。余下清亮的裂解物在液氮中速凍,然后貯存在-70°C。

                用薄層層析法測定 CAT 活性

                5.50ul 細(xì)胞抽提物在 65°C 孵育 10 min 使內(nèi)源性的去乙酰基酶失活。如果這時(shí)候抽提物混濁不透明,在 4°C 最大速度離心 2 min 以去除微粒。

                6. 每個(gè)待測樣品用 80ulCAT 反應(yīng)混合物 1 混合,37°C 孵育。孵育時(shí)間的長短與細(xì)胞抽提物中 CAT 的濃度有關(guān),而 CAT 的濃度又與所研究的啟動(dòng)子強(qiáng)度和細(xì)胞類型有關(guān)。大多數(shù)情況下,孵育 30 min 到 2 h 就足夠了。
                如果轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中 CAT 基因表達(dá)很低,這步反應(yīng)可以孵育更長的時(shí)間(最長至 16 h)。但最在這種情況下,建議毎個(gè)反應(yīng)孵育 2 h 后再補(bǔ)加 10ul 乙酰輔酶 A。

                7. 每個(gè)樣品加 lml 乙基乙酸,振蕩 3 次,每次 10s, *使溶液混勻。混合物在室溫下以最大速度離心 5 min。
                乙酰基化的氯霉素進(jìn)入到有機(jī)相(上層)中;非乙酰基化的氯霉素仍留在水相中。

                8. 用移液管把 900ul 有機(jī)相轉(zhuǎn)移到新管中,小心避免水相和中間相混入。把含有下層相的管子作為放射性廢物丟棄。

                9. 把管子放入旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)器(如 Savant SpeedVac 牌), 真空下使乙基乙酸揮發(fā)約 lh。

                10. 每個(gè)管子加 25ul 乙基乙酸,輕輕振蕩,使反應(yīng)產(chǎn)物溶解。

                11. 把 10~15ul 已溶解的反應(yīng)產(chǎn)物加到 25 mm 硅膠 TLC 板的起點(diǎn)處。板上的起點(diǎn)用軟石墨鉛筆標(biāo)記。每次加樣 5ul, 用吹風(fēng)機(jī)把樣品吹干。

                12. 準(zhǔn)備盛有 200 mlTCL 溶劑的 TCL 槽。把 TCL 板放進(jìn)槽中,關(guān)上容器,然后使溶劑前沿移動(dòng)到板上端大約 75% 的地方。
                可以用許多不同的 TCL 板和指劑來分離乙酰基化的氯霉素。我們通常用氯仿:甲醇 (95:5) 和 Sybron SILG/UV254(Brinkmann 公司)TCL 板。Touchstone(1992) 對 TCL 方法及其疑難問題作了很好的介紹和說明。

                13. 把 TCL 板從槽中取出來,在室溫下干燥。用放射性墨水在 TCL 板上作點(diǎn)標(biāo)記以便于對齊板與膠片的位置,然后用板對 X 射線膠片曝光。或者把板放在磷屏分析的盒子里。盒子在室溫下放置適當(dāng)?shù)臅r(shí)間。
                TCL 板上不要蓋 Satan 膜,因?yàn)樯w上膜之后會隔斷 14C 同位素發(fā)出的較弱的放射線。

                14. 沖洗 X 射線膠片并與 TCL 板校對位置。此外,還可以用層析圖對磷屏分析設(shè)備的圖像板曝光或把 TCL 板拿去掃描。
                通常可看到三個(gè)放射性斑點(diǎn)。從起點(diǎn)遷移距離最近的點(diǎn)是進(jìn)入乙基乙酸的非乙酰基化的氯霉素。另兩個(gè)遷移得稍快的斑點(diǎn)是兩個(gè)潛在的可酰基化位置中的某一個(gè)被乙酰基化的氯霉素。只有當(dāng)使用了高濃度 CAT 或用大量抽提蛋白進(jìn)行長時(shí)間的孵育后,才能看到遷移得更快的第三種斑點(diǎn),它是雙乙酰基化的氯霉素。

                15. 為了對 CAT 活性定量,需要從 TCL 板中把放射性斑點(diǎn)切下來,然后用液閃計(jì)數(shù)器測定放射性量(請見附錄 9)。取另一份細(xì)胞抽提物(來自前面的步驟 3),用 Bradford 分析法等快速比色法確定抽提物中的蛋白濃度。測定蛋白濃度前,把 Triton X-100 的濃度稀釋為≤0.1%, 以免發(fā)生交叉反應(yīng)。CAT 活性表示為每單位時(shí)間每毫克細(xì)胞抽提物蛋白中產(chǎn)生乙酰基化產(chǎn)物的皮摩爾數(shù)。
                當(dāng)處理大量樣品時(shí),先硅膠薄層度析,接著切膠和對修飾過的氯霉素產(chǎn)物進(jìn)行閃爍計(jì)數(shù)的方法會變得非常膩味,這些情況下進(jìn)行產(chǎn)物定量的另一種方法是用磷屏設(shè)備對 TCL 板進(jìn)行掃描。
                在不含細(xì)胞抽提物的情況下仍然「固有」的氯霉素己酰基化可能會形成背景。如果這會有問題,試著把實(shí)驗(yàn)中氯霉素的濃度降低 2-4 倍(Heard et al.1987)。


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